在南水北調(diào)工程科技工作中，取得了大量的新產(chǎn)品、新材料、新工藝、新裝置、計算機軟件等科技成果。完成了專用技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)13項（如：丹江口水利樞紐混凝土壩加高施工技術(shù)規(guī)定與質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)、渠道混凝土襯砌機械化施工技術(shù)規(guī)程、渠道混凝土襯砌機械化施工質(zhì)量評定驗收標(biāo)準(zhǔn)等），申請并獲得國內(nèi)專利數(shù)十項（如：重力壩加高后新老混凝土結(jié)合面防裂方法、長斜坡振動滑模成型機、電動滾筒混凝土襯砌機、電化學(xué)沉積方法修復(fù)混凝土裂縫的裝置等），部分科研成果已應(yīng)用到工程設(shè)計與施工中，對工程質(zhì)量和進度起到了保障作用。多項科技研究成果獲得了國家與省部級科技獎（如：大型渠道混凝土機械化襯砌成型技術(shù)與設(shè)備獲得國家科技進步二等獎；低揚程水泵選型關(guān)鍵技術(shù)及應(yīng)用研究獲大禹水利科學(xué)技術(shù)獎二等獎；淮安四站泵送混凝土防裂方法研究與應(yīng)用獲水利部大禹水利科學(xué)技術(shù)三等獎；pccp輸水阻力試驗研究獲水利部大禹水利科學(xué)技術(shù)獎三等獎；中線一期工程長距離調(diào)配與運行獲教育部科技進步一等獎）。

在工程技術(shù)挑戰(zhàn)面前，采取有效措施：一是在工程建設(shè)之初制定科技工作計劃，開展重大關(guān)鍵技術(shù)研究，率先啟動丹江口大壩加高、pccp管道制造和安裝、東線大流量水泵的設(shè)計和制作等方面的科技研究。二是積極暢通科技創(chuàng)新渠道，落實有關(guān)經(jīng)費，并將科技創(chuàng)新和工程建設(shè)緊密結(jié)合起來。如，中線利用工程建設(shè)費用在南陽、新鄉(xiāng)開展膨脹土（巖）試驗，為工程設(shè)計提供科學(xué)數(shù)據(jù)，提出膨脹土處理有關(guān)措施。中線穿黃工程進行了1：1模型試驗，取得大量設(shè)計及施工參數(shù)，解決設(shè)計方案及施工工藝優(yōu)化比選問題。三是利用市場配置各種資源，為工程技術(shù)創(chuàng)新提供支持。很多科研題目和國家科技規(guī)劃結(jié)合起來，與科技部共同設(shè)立南水北調(diào)重大課題研究項目，列入國家“十一五”科技規(guī)劃。與清華大學(xué)、武漢大學(xué)、河海大學(xué)簽訂科技協(xié)議；利用社會資源組建技術(shù)委員會；與中國水科院和中國工程院建立緊密聯(lián)系。很多課題是通過社會配置資源相互合作來推動的。如，中線水源地黃姜生產(chǎn)工藝研究，請武漢大學(xué)、武漢地質(zhì)大學(xué)、清華大學(xué)、北京大學(xué)等院校，從幾個不同的技術(shù)路線出發(fā)，解決黃姜生產(chǎn)中污染的問題，已經(jīng)取得階段性成果。四是建立科技交流和成果共享機制。把科技成果作為一種公共資源，由成果形成的單位和有關(guān)試用單位共享，廣泛應(yīng)用到工程當(dāng)中去，保證成果的高效性。五是采用引進、吸收、再創(chuàng)新的方式，積極開展國際科技交流。提高國產(chǎn)渠道襯砌機生產(chǎn)水平和工作效率，設(shè)備價格比進口降低80%，自重降低三分之二，不僅滿足國內(nèi)需求，還出口到巴基斯坦、馬來西亞等國外市場。